Zgodnie ze sprawozdaniem z wykonania tej dyrektywy z 2021 r. w latach 2016-2019 przyznano odstępstwa Danii, Irlandii, Włochom (regiony Lombardia i Piemonte), Belgii (region Flandria) i Holandii. Odstępstwa przyznano również Zjednoczonemu Królestwu (Anglii, Szkocji i Walii, a także Irlandii Północnej). COM (2021) 1000 final, Sprawozdanie Komisji z wykonania dyrektywy Rady 91/676/EWG dotyczącej ochrony wód przed zanieczyszczeniami powodowanymi przez azotany pochodzenia rolniczego na podstawie sprawozdań państw członkowskich za lata 2016–2019.